El Tribunal Superior de Justícia de Catalunya va ordenar tancar la web del referèndum amb els col·legis per votar l'1 d'octubre, és a dir, "adoptar mesures tècniques oportunes per deixar de forma immediata fora de línia el servei". Malgrat això, Cerdanyola del Vallès vol cedir espais municipals per dur a terme el referèndum.
Els locals serien els habituals d'eleccions passades com els que es van utilitzar a les últims comicis al Parlament de Catalunya, l'any 2015. Els cerdanyolencs podran votar en un total de 13 col·legis electorals repartits en l'Escola de Música Aulos, l'IES Banús, el Centre Cívic de Bellaterra, el col·legi Carles Buïgas, el CEIP Fontetes, el CMEIP La Sínia, el Centre Cívic de Montflorit, el CEIP Saltells, CEIP Sant Martí, CEIP Serraparera, l'Espai Infantil (també conegut com a Centre Recursos Pedagògics), CEIP Turó de Guiera i CEIP Xarau.
No obstant això, des de dimarts 26 de setembre, els Mossos d'Esquadra han començat a identificar i notificar als responsables d'algunes escoles de Cerdanyola, que actuen habitualment com a col·legis electorals. A dia 27 de setembre, els agents han contactat. com a mínim amb tres escoles de la ciutat i es preveu que el procés s'allargui a tots els centres, en funció de la disponibilitat d'agents en cada territori.