Un equip de l'Institut de Biotecnologia i de Biomedicina (IBB) de la Universitat Autònoma de Barcelona (UAB) ha creat noves eines bioinformàtiques que permeten analitzar el comportament de les proteïnes que formen condensats moleculars, un procés implicat en l'envelliment, el funcionament cel·lular i diverses malalties neurodegeneratives.
Què vol dir la creació d'aquestes eines?
El procés s'anomena separació per fases líquid-líquid (LLPS), i durant aquest algunes proteïnes s'agrupen de manera espontània dins de la cèl·lula per crear estructures moleculars sense membrana. Aquestes estructures són els condensats moleculars i tenen funcions molt importants: organitzen les funcions cel·lulars, regulen les interaccions entre les proteïnes i permeten una resposta interna flexible i controlada.
Si el procés LLPS falla, pot contribuir al desenvolupament de malalties neurodegeneratives com ara l'Alzheimer, el Parkinson, alguns càncers o trastorns del desenvolupament. D'aquesta manera, comprendre la LLPS i predir quines proteïnes formen els condensats podria influir positivament en el desenvolupament de tractaments dirigits o estratègies d'intervenció inicial per aquestes malalties.
Investigació
Els investigadors de la UAB han reunit i classificat la base de dades més completa i fiable que existeix fins ara sobre proteïnes implicades en aquest fenomen, i han diferenciat entre les que poden generar condensats per si soles (drivers) i les que només en formen part (clients). L'estudi ha identificat i classificat amb precisió 2.876 proteïnes implicades en la LLPS.
Abans de desenvolupar les seves pròpies eines bioinformàtiques, l'equip va comparar-ne 16 de les eines actuals per valorar la seva eficàcia, millorant així la seva capacitat predictiva. Els recursos que s'han generat s'han posat a la disposició de la comunitat científica mitjançant una plataforma en línia amb l'objectiu d'esdevenir un marc més sòlid per a futures investigacions biomèdiques.
Segueix-nos per saber què passa a la ciutat.
Subscriu-te gratuïtament al WhatsApp, Telegram i butlletí electrònic. I pots seguir-nos a Facebook, Twitter i Instagram.